本所為因應國家2050淨零碳排的政策推動，設計出符合現行法規規範之專案，碳抵換專案設計涉及許多項目，亦導入農業部強力發展之企業農業ESG，為整合相關成員之專長與資訊共享、有效執行相關政策，本所成立跨組室的臨時性「自然碳匯策略工作小組」，並分為「量測技術執行」、「發展友善農業」、「鏈結企業ESG」、「推廣環境教育」等四個項目，與相對應協力的人員編組，以全方位多角度應對相關議題與資源配置。
成員如下：
召集人楊嘉棟 所長
副召集人林旭宏 副所長
鄭錫奇 主任秘書
總幹事野生植物組 林子超 副研究員
副總幹事兼聯繫窗口野生植物組 王經文 副研究員
一、量測技術執行
野生植物組 王經文 副研究員
保育推廣組 薛美莉 研究員
野生植物組 李麗華 副研究員
野生植物組 黃朝卿 助理研究員
野生植物組 陳添水 助理研究員
二、發展友善農業
野生動物組 林育秀助理研究員
生態系經營組 林大利 助理研究員
野生動物組 陳榮宗 助理研究員
三、鏈結企業ESG
保育推廣組 薛美莉 研究員
野生動物組 林育秀 助理研究員
生態系經營組 林大利 助理研究員
資源管理組 柯智仁 助理研究員
四、推廣環境教育
保育推廣組 薛美莉 研究員
保育推廣組 江郁宣 助理研究員
保育推廣組 許哲維 研究助理